PATHOGAZ : impact sanitaire de la méthanisation agricole mésophile
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PATHOGAZ : impact sanitaire de la méthanisation agricole mésophile

Etude de la persistance des bactéries pathogènes et /ou résistantes aux antibiotiques le long de la filière

Présentation

L'impact des post-traitements des digestats dépend du type de traitement, le compostage apparaissant le plus efficace, et de facteurs intrinsèques à la bactérie. Ainsi, les capacités de survie des bactéries le long de la filière sont dans l'ordre croissant : Campylobacters thermotolérants < Salmonella et E. coli < entérocoques intestinaux et Listeria monocytogenes < bactéries formant des spores (Clostridium perfringens, Clostridium botulinum et Clostridioides difficile). La comparaison du core-genome des souches montre qu'au sein d'une même espèce, certaines sont capables de persister le long de la filière alors que d'autres possèdent un profil génomique non retrouvé dans les lisiers suggérant qu'elles peuvent provenir des co-substrats alimentant les méthaniseurs et / ou être issues d'une contamination extérieure lors du stockage des digestats post-traités. En utilisant une souche de E. coli receveuse, aucun transconjugant n'a été obtenu à partir des digestats, des post-digestats et du compost dans les conditions de l'étude. Les gènes de résistance aux antibiotiques, initialement présents dans les lisiers et les fumiers, persistent le long de la filière de méthanisation mais la digestion anaérobie mésophile conduit à un abattement significatif de leurs abondances. Le compostage diminue l'abondance absolue des gènes étudiés contrairement au simple stockage de la phase solide ou de la phase liquide suggérant que le stockage n'est pas suffisant pour faire chuter la présence des gènes de résistance dans ces matrices utilisées comme amendements.
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Caractéristiques

Date de mise en ligne
18/04/2025
Type de document
Etude/Recherche
Nb. de pages
83 P
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L'impact des post-traitements des digestats dépend du type de traitement, le compostage apparaissant le plus efficace, et de facteurs intrinsèques à la bactérie. Ainsi, les capacités de survie des bactéries le long de la filière sont dans l'ordre croissant : Campylobacters thermotolérants < Salmonella et E. coli < entérocoques intestinaux et Listeria monocytogenes < bactéries formant des spores (Clostridium perfringens, Clostridium botulinum et Clostridioides difficile). La comparaison du core-genome des souches montre qu'au sein d'une même espèce, certaines sont capables de persister le long de la filière alors que d'autres possèdent un profil génomique non retrouvé dans les lisiers suggérant qu'elles peuvent provenir des co-substrats alimentant les méthaniseurs et / ou être issues d'une contamination extérieure lors du stockage des digestats post-traités. En utilisant une souche de E. coli receveuse, aucun transconjugant n'a été obtenu à partir des digestats, des post-digestats et du compost dans les conditions de l'étude. Les gènes de résistance aux antibiotiques, initialement présents dans les lisiers et les fumiers, persistent le long de la filière de méthanisation mais la digestion anaérobie mésophile conduit à un abattement significatif de leurs abondances. Le compostage diminue l'abondance absolue des gènes étudiés contrairement au simple stockage de la phase solide ou de la phase liquide suggérant que le stockage n'est pas suffisant pour faire chuter la présence des gènes de résistance dans ces matrices utilisées comme amendements.

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PDF - 3.77MB

Caractéristiques
Auteurs
ADEME
INRAe
ANSES
Public(s)
Agriculture et Forêt
Monde de la recherche
Entreprises et fédérations professionnelles
Type de document
Etude/Recherche
Thématique
Economie circulaire et Déchets
Collection
Expertises
Date d'édition
04/2023
Date de mise en ligne
18/04/2025
Nb. de pages
83 P
Format
pdf/A4
Langue
Français
Périmètre de publication
National

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