Caractérisation de la biodiversité de la faune du sol par metabarcoding de l'ADN environnemental
Projet RMQS ADNe
Présentation
Les travaux portent sur la caractérisation de la faune du sol par metabarcoding d’ADN environnemental dans le cadre de la campagne 2024 du RMQS-Biodiversité. Quatre marqueurs génétiques ciblant différents groupes (eucaryotes, arthropodes, oligochètes et collemboles) ont été utilisés. Les résultats confirment que le metabarcoding est un outil pertinent pour l’analyse des patrons de variation de la diversité de la faune du sol. Ses limites sont connues : des différences de détectabilité entre taxons et l’incomplétude des bases de référence réduisent encore, pour certains groupes, la concordance avec les inventaires traditionnels basés sur une identification par critères morphologiques. Les résultats obtenus avec le marqueur Euka02 montrent en particulier un fort potentiel pour discriminer les communautés selon l’usage des sols, avec également de bonnes performances pour évaluer la diversité en intégrant simultanément la richesse et l’équitabilité des communautés.
Caractéristiques
- Date de mise en ligne
- 04/12/2025
- Type de document
- Etude/Recherche
- Nb. de pages
- 58 P
Les travaux portent sur la caractérisation de la faune du sol par metabarcoding d’ADN environnemental dans le cadre de la campagne 2024 du RMQS-Biodiversité. Quatre marqueurs génétiques ciblant différents groupes (eucaryotes, arthropodes, oligochètes et collemboles) ont été utilisés. Les résultats confirment que le metabarcoding est un outil pertinent pour l’analyse des patrons de variation de la diversité de la faune du sol. Ses limites sont connues : des différences de détectabilité entre taxons et l’incomplétude des bases de référence réduisent encore, pour certains groupes, la concordance avec les inventaires traditionnels basés sur une identification par critères morphologiques. Les résultats obtenus avec le marqueur Euka02 montrent en particulier un fort potentiel pour discriminer les communautés selon l’usage des sols, avec également de bonnes performances pour évaluer la diversité en intégrant simultanément la richesse et l’équitabilité des communautés.
- Auteurs
-
LABORATOIRE d'ECOLOGIE ALPINE
FOULQUIER Arnaud
COFFIE David-Emmanuel
MIQUEL Christian
RIOUX Delphine
MULERO Stéphane
BOYER Frédéric
- Public(s)
-
Monde de la recherche
- Type de document
-
Etude/Recherche
- Thématique
-
Urbanisme, territoires et sols
Agriculture, alimentation, forêt, bioéconomie
- Collection
-
Expertises
- Date d'édition
-
06/2024
- Date de mise en ligne
-
04/12/2025
- Nb. de pages
-
58 P
- Langue
-
Français
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