Biogéographie et écologie spatiale des champignons du sol à l'échelle de la France FungiMic-RMQS

Le projet FungiMic-RMQS propose d'analyser et de valoriser d'un point de vue fondamental la diversité taxonomique des champignons des sols français caractérisée sur le Réseau de Mesure de la Qualité des Sols de la campagne 1. La diversité fongique a été caractérisée grâce à des techniques de séquençage massif (Illumina HiSeq) d'amplicons du gène taxonomique, l'ARNr 18S, directement à partir de l'ADN extrait des sols. Les résultats ont permis de calculer la richesse spécifique fongique moyenne en France (~1 500 UTOs). Les paramètres environnementaux expliquent cette richesse fongique à hauteur de 18,42 % et avec comme premier filtre environnemental le type de sol et ses paramètres physico-chimiques, puis le mode d'usage et les descripteurs spatiaux. Cette richesse spécifique suit une hiérarchie en fonction du degré de perturbation anthropique des sols avec une richesse plus faible dans les sols de forêts par rapport aux sols de prairies et de grandes cultures. Pour le degré de perturbation le plus élevé, c'est à dire au niveau des vignes & vergers, la richesse diminue pour se situer au niveau de celle des forêts. L'analyse taxonomique a permis d'identifier 9 phyla majeurs, cosmopolites et leur hiérarchie varie en fonction du mode d'usage. L'étude des réseaux d'interactions fongique, a permis d'observer une perte de 90 % de la complexité et de la stabilité du réseau entre les sols de forêts et les sols de vignes & vergers. L'ensemble de ces connaissances permettra d'alimenter les réflexions menées par les politiques publiques nationales et européennes sur les directives de protection des sols (p. ex. GisSol, OFB, FRB, Ministère de la transition écologique, EU).